선생은 회의를 개최한 후 다시 광수장터에서 군세를 바로잡고 병사들을 훈련시켜 공주관아를 공격하기로 하였다. 선두부대가 묵방(일명 먹고개, 현재 청양군 비봉면 중묵리)에 이르렀을 때 공주병력과 경병 300여명이 청양읍에서 휴식중이라는 척후병의 보고가 들어왔다. 의병은 진로를 화성으로 옮겨 합천 일대에 진을 쳤다. 이날 관군과 일본군은 오후 6시 먹고개에 도착하여 탐문하고 10시경 합천 인근으로 쳐들어와 잠복하였다. 다음날(3월 17일) 오전 5시 의병진은 이들로부터 기습을 받아 안병찬과 박창로 등 23명이 체포되었다. 안병찬은 이남규 등의 노력으로 선생이 홍산에서 재기하기 4일전인 5월 5일(음, 4월 12일) 석방되어 의진의 참모사로 다시 종군하였다.
합천전투 이후 선생은 각지를 잠행하다가 전주의 친족인 민진양(閔晉錫) 집에서 지내던 중, 조상수(趙尙洙)·이용규·이세영·이상구(李相龜)·이봉학(李鳳學) 등과 재기를 협의하였다. 그리고 "원근에서 바람처럼 모여든 60여인과 함께" 5월 9일(음, 4월 16일) 충청남도 홍산군 지티동의 주막에서 거의하고 대장에 추대되었던 것이다. 홍순대의 {해암사록}에는, "산과 들을 헤매면서 왜놈의 눈을 피했던 의병들이 4월 19일 홍산군 내산면 지치리에 다시 모였다"라고 패산했던 의병들이 선생의 재기 소식을 듣고 다시 홍산에 모여들었음을 알려주고 있다. 이때 선생은 선봉에 박영두(朴永斗), 중군장에 정재호(鄭在鎬), 후군장에 정해두(鄭海斗)를 임명하였다.
지티 봉기를 가능하게 하는데 처남인 이용규의 역할이 컸다. 이용규는 합천싸움에서 패한 뒤 전주·진안·용담·장수·무주 등지를 돌아다니며 의병을 모았으며, 서천과 인근의 남포·오천 등지에서도 의병 모집 활동과 함께 식량을 준비하였다.
5월 13일(음, 4월 20일) 선생은 의병을 이끌고 서천읍을 공격하였다. 관아에 돌입한 의병부대는 서천군수 이종석(李鍾奭)을 감금하고 양총 등 무기를 획득하였다. 이때 선생은 군수의 인장을 이용하여 의병을 모집하기도 하였다. 다음날 비인을 함락하고 남포에 가는 도중에 일본인 한 명을 체포하였으며, 남포에 들어가 읍성을 공격하였다. 선생이 지휘하는 의병부대의 공격에 관군은 요새인 남포읍성을 지키며 방어하였고, 나중에는 공주의 관군까지 합세하여 반격하였다. 그럼에도 불구하고 4일간의 전투 끝에 선생의 의병부대는 승리를 거두었다. 남포군수 서상희(徐相喜)는 잡아 감금하고 관군 31명을 의병진에 귀순시키고 군량을 확보하였다. 이때 남포의 유생 유준근이 유회군(儒會軍) 33명을 거느리고 와 합세함에 그를 유병장(儒兵將)으로 삼았다. 그 후 남포부근의 용동에서 일본인 2명을 체포하여 1명을 총살시키고, 이어서 광천에서도 일본인 6명을 체포한 뒤, 결성에서 하루를 지냈다.
선생이 이끈 의병부대가 홍주성을 공격한 것은 홍주 장날인 5월 19일(음, 4월 26일)이었다. 1천여 명에 달하는 의병부대는 홍주의 삼신당리에서 일본군과 싸워 이기고 구식 화포 2문을 선두에 내세워 홍주성을 포위 공격하였다. 의병부대의 우세한 공격을 당해내지 못한 일본군과 관군은 북문을 통해 덕산방면으로 도주하였다. 드디어 홍주성이 의병들에 의하여 탈환된 것이다.